Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGB3BPQ13352 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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