Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATMQ13315 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATMQ13315 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATMQ13315 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATMQ13315 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATMQ13315 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATMQ13315 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ATMQ13315 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATMQ13315 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATMQ13315 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ATMQ13315 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATMQ13315 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATMQ13315 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATMQ13315 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATMQ13315 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATMQ13315 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATMQ13315 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATMQ13315 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATMQ13315 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATMQ13315 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATMQ13315 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATMQ13315 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATMQ13315 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATMQ13315 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATMQ13315 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATMQ13315 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATMQ13315 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATMQ13315 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATMQ13315 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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