Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM28Q13263 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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