Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME3Q13232 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME3Q13232 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME3Q13232 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME3Q13232 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME3Q13232 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME3Q13232 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME3Q13232 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME3Q13232 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME3Q13232 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NME3Q13232 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME3Q13232 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME3Q13232 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME3Q13232 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME3Q13232 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME3Q13232 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME3Q13232 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME3Q13232 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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