Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAF3Q13114 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAF3Q13114 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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