Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1BQ13112 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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