Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TP53BP1Q12888 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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TP53BP1Q12888 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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TP53BP1Q12888 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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TP53BP1Q12888 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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TP53BP1Q12888 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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TP53BP1Q12888 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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TP53BP1Q12888 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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TP53BP1Q12888 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
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TP53BP1Q12888 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TP53BP1Q12888 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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