Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFSWAPQ12872 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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