Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KCNH2Q12809 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNH2Q12809 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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