Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CGNL1Q0VF96 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CGNL1Q0VF96 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms