Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms