Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPAL4Q0D2K0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPAL4Q0D2K0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms