Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLFN5Q08AF3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLFN5Q08AF3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms