Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK1Q08629 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms