Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DSC1Q08554 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DSC1Q08554 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DSC1Q08554 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DSC1Q08554 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DSC1Q08554 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DSC1Q08554 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSC1Q08554 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSC1Q08554 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSC1Q08554 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSC1Q08554 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSC1Q08554 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DSC1Q08554 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DSC1Q08554 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DSC1Q08554 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DSC1Q08554 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DSC1Q08554 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DSC1Q08554 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DSC1Q08554 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DSC1Q08554 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DSC1Q08554 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSC1Q08554 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DSC1Q08554 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DSC1Q08554 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms