Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNDQ07001 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNDQ07001 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms