Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms