Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG1Q06432 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG1Q06432 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG1Q06432 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG1Q06432 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG1Q06432 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG1Q06432 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG1Q06432 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG1Q06432 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG1Q06432 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG1Q06432 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG1Q06432 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms