Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms