Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRKCDQ05655 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms