Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
ATP7AQ04656 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP7AQ04656 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms