Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms