Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms