Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEX3Q00994 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX3Q00994 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms