Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP1Q00587 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP1Q00587 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms