Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTD2P86397 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTD2P86397 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HTD2P86397 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HTD2P86397 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HTD2P86397 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HTD2P86397 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HTD2P86397 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms