Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC5P78333 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC5P78333 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC5P78333 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC5P78333 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC5P78333 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC5P78333 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC5P78333 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC5P78333 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC5P78333 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC5P78333 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC5P78333 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC5P78333 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC5P78333 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC5P78333 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC5P78333 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC5P78333 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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