Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBA52P62987 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBA52P62987 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBA52P62987 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBA52P62987 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBA52P62987 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBA52P62987 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBA52P62987 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBA52P62987 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBA52P62987 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBA52P62987 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBA52P62987 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBA52P62987 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBA52P62987 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBA52P62987 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBA52P62987 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBA52P62987 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBA52P62987 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms