Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL11P62913 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL11P62913 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL11P62913 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms