Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RPS29P62273 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPS29P62273 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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