Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFM1P61960 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFM1P61960 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFM1P61960 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFM1P61960 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFM1P61960 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFM1P61960 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFM1P61960 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFM1P61960 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFM1P61960 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFM1P61960 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFM1P61960 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFM1P61960 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFM1P61960 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFM1P61960 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFM1P61960 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFM1P61960 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFM1P61960 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFM1P61960 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFM1P61960 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UFM1P61960 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFM1P61960 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFM1P61960 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UFM1P61960 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UFM1P61960 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UFM1P61960 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UFM1P61960 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
UFM1P61960 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UFM1P61960 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UFM1P61960 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UFM1P61960 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UFM1P61960 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFM1P61960 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFM1P61960 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFM1P61960 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFM1P61960 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFM1P61960 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFM1P61960 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFM1P61960 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFM1P61960 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFM1P61960 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFM1P61960 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFM1P61960 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFM1P61960 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFM1P61960 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFM1P61960 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms