Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN1P60606 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN1P60606 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms