Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX16P57768 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX16P57768 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX16P57768 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX16P57768 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX16P57768 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX16P57768 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX16P57768 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX16P57768 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX16P57768 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX16P57768 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX16P57768 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX16P57768 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX16P57768 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX16P57768 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX16P57768 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX16P57768 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX16P57768 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX16P57768 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX16P57768 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX16P57768 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX16P57768 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX16P57768 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms