Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX9P55771 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX9P55771 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX9P55771 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX9P55771 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX9P55771 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX9P55771 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX9P55771 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX9P55771 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX9P55771 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX9P55771 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX9P55771 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX9P55771 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX9P55771 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX9P55771 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX9P55771 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX9P55771 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX9P55771 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX9P55771 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX9P55771 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX9P55771 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX9P55771 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX9P55771 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX9P55771 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX9P55771 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX9P55771 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX9P55771 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX9P55771 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX9P55771 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX9P55771 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX9P55771 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX9P55771 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX9P55771 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX9P55771 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX9P55771 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX9P55771 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX9P55771 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX9P55771 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX9P55771 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms