Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF10P55107 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF10P55107 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF10P55107 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF10P55107 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF10P55107 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF10P55107 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF10P55107 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF10P55107 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF10P55107 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF10P55107 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF10P55107 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF10P55107 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF10P55107 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF10P55107 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF10P55107 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDF10P55107 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF10P55107 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF10P55107 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF10P55107 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF10P55107 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF10P55107 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF10P55107 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF10P55107 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF10P55107 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GDF10P55107 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF10P55107 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF10P55107 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF10P55107 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF10P55107 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF10P55107 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF10P55107 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF10P55107 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF10P55107 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF10P55107 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF10P55107 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF10P55107 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF10P55107 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF10P55107 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF10P55107 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDF10P55107 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDF10P55107 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDF10P55107 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDF10P55107 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms