Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD4P55036 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD4P55036 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD4P55036 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMD4P55036 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMD4P55036 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMD4P55036 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMD4P55036 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMD4P55036 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMD4P55036 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMD4P55036 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMD4P55036 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms