Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RARSP54136 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RARSP54136 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RARSP54136 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RARSP54136 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARSP54136 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARSP54136 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARSP54136 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARSP54136 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARSP54136 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARSP54136 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RARSP54136 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARSP54136 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARSP54136 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARSP54136 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARSP54136 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARSP54136 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARSP54136 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARSP54136 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARSP54136 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARSP54136 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARSP54136 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARSP54136 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARSP54136 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARSP54136 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARSP54136 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARSP54136 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARSP54136 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARSP54136 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARSP54136 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARSP54136 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARSP54136 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARSP54136 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARSP54136 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARSP54136 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARSP54136 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARSP54136 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARSP54136 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARSP54136 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARSP54136 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARSP54136 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARSP54136 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARSP54136 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARSP54136 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARSP54136 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARSP54136 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARSP54136 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARSP54136 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARSP54136 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARSP54136 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARSP54136 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARSP54136 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARSP54136 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARSP54136 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARSP54136 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RARSP54136 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RARSP54136 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARSP54136 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms