Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNP53814 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMTNP53814 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMTNP53814 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMTNP53814 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMTNP53814 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMTNP53814 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMTNP53814 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMTNP53814 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMTNP53814 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMTNP53814 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMTNP53814 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMTNP53814 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMTNP53814 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMTNP53814 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMTNP53814 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMTNP53814 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMTNP53814 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms