Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACLYP53396 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACLYP53396 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACLYP53396 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACLYP53396 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACLYP53396 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACLYP53396 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACLYP53396 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACLYP53396 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACLYP53396 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACLYP53396 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACLYP53396 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACLYP53396 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACLYP53396 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACLYP53396 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACLYP53396 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACLYP53396 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACLYP53396 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACLYP53396 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACLYP53396 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACLYP53396 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACLYP53396 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACLYP53396 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACLYP53396 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACLYP53396 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACLYP53396 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACLYP53396 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACLYP53396 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACLYP53396 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACLYP53396 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACLYP53396 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACLYP53396 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACLYP53396 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACLYP53396 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACLYP53396 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACLYP53396 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACLYP53396 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACLYP53396 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACLYP53396 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACLYP53396 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACLYP53396 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACLYP53396 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACLYP53396 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACLYP53396 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACLYP53396 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACLYP53396 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACLYP53396 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACLYP53396 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACLYP53396 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACLYP53396 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACLYP53396 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACLYP53396 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACLYP53396 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACLYP53396 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACLYP53396 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms