Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LUMP51884 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LUMP51884 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LUMP51884 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LUMP51884 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LUMP51884 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LUMP51884 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LUMP51884 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LUMP51884 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LUMP51884 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LUMP51884 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms