Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCA2P51587 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms