Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSEN2P49810 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSEN2P49810 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms