Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms