Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP1P48552 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms