Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCLMP48507 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCLMP48507 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCLMP48507 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCLMP48507 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCLMP48507 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCLMP48507 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCLMP48507 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCLMP48507 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCLMP48507 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCLMP48507 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCLMP48507 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCLMP48507 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCLMP48507 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCLMP48507 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCLMP48507 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms