Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms