Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms