Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBP2P32456 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBP2P32456 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP2P32456 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP2P32456 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP2P32456 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP2P32456 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP2P32456 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP2P32456 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP2P32456 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP2P32456 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP2P32456 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP2P32456 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP2P32456 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP2P32456 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP2P32456 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP2P32456 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP2P32456 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GBP2P32456 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GBP2P32456 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
GBP2P32456 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP2P32456 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP2P32456 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms