Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP1P32455 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP1P32455 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP1P32455 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GBP1P32455 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GBP1P32455 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP1P32455 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP1P32455 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBP1P32455 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP1P32455 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP1P32455 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBP1P32455 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP1P32455 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP1P32455 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms