Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDI1P31150 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDI1P31150 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GDI1P31150 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDI1P31150 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDI1P31150 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDI1P31150 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GDI1P31150 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDI1P31150 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDI1P31150 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDI1P31150 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDI1P31150 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDI1P31150 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDI1P31150 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDI1P31150 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDI1P31150 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDI1P31150 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDI1P31150 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDI1P31150 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDI1P31150 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GDI1P31150 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDI1P31150 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDI1P31150 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDI1P31150 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDI1P31150 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDI1P31150 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDI1P31150 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms