Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-FP30511 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-FP30511 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms